Surface - PyMOLWiki
2016年10月24日 · To color the surface representation a different color than the underlying cartoon or ligand representations, simply duplicate the object, show only the surface in the duplicate, and show only the cartoon and/or ligands in the original object. Or use the surface_color setting that is available.
PyMOL作图：同时显示“Cartoon“ + “Surface“ - CSDN博客
2023年9月11日 · 参考了一下 PyMolWiki 中的 Transparency 命令，因为其他的像 Cartoon 、 Sphere 、 Stick 人家都有自带的设置 透明度 的命令。 而 Surface 需要用这个全局的设置 Transparency 透明度的命令来调整。 教程中的模板长这样⬇，是不是和上图效果如出一辙？ 所以只需要在PyMol中同时显示“ Cartoon ”和“ Surface ”，再调整 整体的 透明度即可。 在PyMOL命令行中输入以下命令。 set surface_color, deepblue. set transparency, 0.65. 并且，还可以做到给 …
Pymol作图技巧之cartoon和surface镶嵌模型 - 知乎 - 知乎专栏
2019年9月23日 · Pymol创建一定透明度的surface，里面包含cartoon模型。 show cartoon #显示cartoon show surface #显示表面 hide lines #隐藏lines set surface_color,green #修改表面颜色，green为可修改参数 set transparency,0.4 #设置表面透明度，0.4为可修改参数，一般0.1到0.9 set surface_quality,1 #设置表面质量
Pymol教程--surface/cartoon透明度的调节(静电势能) - CSDN博客
2022年5月26日 · Pymol教程–surface/cartoon透明度的调节(静电势能) 视频教程来自于钰沐菡， https://www.bilibili.com/video/BV1bZ4y1G765?spm_id_from=333.999.0.0. Step1, 下载蛋白:fetch 4pl6. Setp2, 隐藏Non-bonded interactions - 非键接相互作用. Setp3，生成静电势能. Setp4， 设置透明度，setting->edit all. Setp5,选择 ...
Pymol快速做出Surface-cartoon图详细步骤 - CSDN博客
2024年1月18日 · 一个对象为cartoon, 一个对象为surface. 对象操作. 接着就可以对这两个对象进行操作了。 1、Display——Backgroud——white #将背景设置为白色. 2、通过S下单选项将pro_surface对象Show as 为surface模式. 3、通过C下拉选项将pro_surface对象设为greys颜色. 4、设置surface透明度，假设 ...
Unlock the Power of PyMOL: Elevate Your Protein ... - Neurosnap
2023年5月17日 · PyMol offers a number of different ways we can visualize our proteins and molecules. The most important ones that we're going to cover consist of cartoon representation, backbone, backbone + side chain, and surface. Cartoon. The most commonly used 3D representation of proteins and complexes probably consists of the cartoon models.
Making Pretty Pictures with PyMOL | Oxford Protein Informatics …
My favourite setting is 1, but 3 can be fun to make things a bit more cartoon-ish. You can also improve the quality of the image by increasing the ‘surface_quality’ and ‘cartoon_sampling’ settings. Ambient Light. I think the default lighting in PyMOL is quite dark, and the colours aren’t quite as vibrant as I’d like them.
Pymol-surface/cartoon透明度的调节(静电势能) - 哔哩哔哩
Pymol-surface/cartoon透明度的调节(静电势能), 视频播放量 16734、弹幕量 8、点赞数 340、投硬币枚数 217、收藏人数 577、转发人数 99, 视频作者 钰沐菡-YuMuhan, 作者简介 药物研发，CADD，AIDD，全网同名，相关视频：Pymol绘制蛋白配体口袋，发文必备|两分钟学会蛋白表面 ...
Pymol（1.8.6）作图技巧之cartoon和surface镶嵌模型-阿里云开发 …
2021年12月7日 · `matplotlib`是Python中一个非常流行的绘图库，它提供了丰富的绘图接口，包括二维和三维图形的绘制。`Axes3D`是`matplotlib`中用于创建三维坐标轴的对象，而`plot_surface`则是用于在三维空间中绘制表面的函数。
Surface (TV Series 2005–2006) - IMDb
Surface: Created by Jonas Pate, Josh Pate. With Lake Bell, Jay R. Ferguson, Carter Jenkins, Leighton Meester. A marine biologist, an insurance salesman and a teen-aged boy find their lives fundamentally changed by the emergence of a new, and often dangerous, species of sea life, while government agents work to keep the affair under wraps.