今天,刊登在《Science》封面上一项最新研究,美国 Arc 研究所(Arc Institute)和斯坦福大学的研究团队提出了一种机器学习模型「Evo」,其能够以无与伦比的准确性解码和设计从分子到基因组规模的 DNA、RNA 和蛋白质序列。
基因包含制造蛋白质的指令,生物学的中心法则是这些信息从DNA流向RNA,再流向蛋白质。但实际上只有2%的人类基因组能够编码蛋白质;其余98%的功能在很大程度上仍然未知。人类遗传学的一个紧迫问题是了解这些基因组区域的作用——如果有的话。从历史上看,有些人甚至把这些地区称为“垃圾”。现在,《细胞》杂志的一项新研究发现,一些非编码rna实际上并不是垃圾——它们是功能性的,在我们的细胞中发挥着重要作用,包 ...
在过去数十年中,RNA的生物学角色发生了深刻的变化。最初,RNA被认为只是介于DNA与蛋白质之间的中间信息载体,但现代研究已经揭示RNA的功能远超简单的遗传信息传递。尤其是环状RNA(circular RNA, ...
环形 RNA(circular RNA,circRNA)是一类广泛存在于真核细胞中的内源性非编码 RNA 分子,在生物体发育过程中发挥着重要作用。其独特的环状结构使其免受外切酶降解,因此比线性 RNA 更加稳定。自 2010 ...
最近,斯坦福大学与加州大学伯克利分校的研究团队推出了一项重磅研究,推出了一种名为Evo的新型深度学习模型,它不仅登上了《Science》杂志的封面,还向合成生物学的未来开辟了新方向。Evo模型在DNA、RNA和蛋白质的设计与生成方面展现出了前所未有的准确性与效率,标志着这一领域的颠覆性突破。 Evo模型的核心创新在于其强大的参数规模和上下文处理能力,具有高达70亿的参数,这使得它在单核苷酸的分辨率 ...
Patho-DBiT利用DNA条形码绘制RNA和蛋白的空间关系图,对RNA(某些类型的RNA在癌症中具有调控作用)进行全面探究。这项技术的独特之处在于,它拥有微流体设备,能从两个方向将条形码送入组织,形成独特的二维像素“马赛克”,提供空间信息,从而可 ...